Управление Учреждением осуществляется на основе сочетания принципов единоначалия и коллегиальности.

Единоличным исполнительным органом Учреждения является заведующий, назначаемый на должность и освобождаемый от должности в соответствии с муниципальными правовыми актами Учредителя. 

Структурных подразделений нет.

Органами коллегиального управления являются:

- Общее собрание работников в МБДОУ «Кугесьский детский сад «Крепыш» (Положение);

- Педагогический совет в МБДОУ «Кугесьский детский сад «Крепыш» (Положение);

- Управляющий совет МБДОУ "Кугесьский детский сад "Крепыш" (Положение).